Übersicht

Biobanken und Speicherorte für Bioproben sind für die klinische und bioindustrielle Forschung heutzutage unerlässlich. Eine vollständige Ausnutzung von Biobanken hängt vom Grad der Datenstandardisierung und der Verfügbarkeit von Informationen über die Bioaufbewahrungsorte ab. Da diese Informationen in unterschiedlichen Umgebungen entstehen, kann die Umsetzung von Standards zu einer Herausforderung werden. Eine automatisierte Probenregistrierung senkt die Wahrscheinlichkeit menschlicher Fehler und eignet sich am besten für die Umwandlung, Bereinigung und andere Aufgaben, die mit der Datenpflege verbunden sind. BC Platforms bietet viele unterschiedliche Module zur Standardisierung von klinischen Daten und die Nachverfolgung von Proben an, die in Kombination genutzt werden können, um eine leistungsstarke Datenbank innerhalb Ihrer Biobank aufzubauen.

BC Platforms hat viel Erfahrung bei der Errichtung einer zentralen Datenverwaltung für verteilte Erfassung. Wir können Sie bezüglich ihrer spezifischen Bedürfnisse hinsichtlich Konnektivität und Datenverfügbarkeit beraten und Ihre verteilten Datenknoten integrieren, um eine verwaltbare Ansicht Ihrer unterschiedlichen Datenquellen zu erschaffen.

Eine detailliertere Präsentation unseres Produktportfolios für Biobanken können Sie hier herunterladen.

BC|MERGE

Die Integration unterschiedlicher Datenquellen in eine zugängliche und vereinheitlichte Sammlung ist die größte Herausforderung in der Biologie- und Medizinforschung. Der Bedarf an Integration hat zwei Ebenen: Harmonisierung von Daten, die in unterschiedlichen Umgebungen und durch verschiedene Instrumente erstellt wurden, und Verschmelzung von Daten, die in unterschiedlichen Sammlungen gehostet sind. BC|MERGE meistert beide Dimensionen durch das innovative BC Virtual File System und automatisierte Arbeitsabläufe für die Datenpflege und -harmonisierung an.

Geografisch verteilte Sammlungen

Das BC Virtual File System implementiert Portale für Datenbanken und Datenaustauschknoten
Zugang zu geschützten URL und privaten Web-Diensten
Übertragung von Daten durch Firewalls vom Dienstleister zum Verbraucher
Öffentliche Ressourcen als externe Datensätze

Sammlungen mit einer Kombination von Daten aus unterschiedlichen Umgebungen

Umwandlung von Daten in unterschiedliche Formate in einer vereinheitlichten Sammlung
Datenbearbeitung, um Schreibfehler und Probleme für messbare Daten zu vermeiden
Umsetzung eines ausgewählten Datenstandards
Zusammenschluss zwischen den Identifikationsangaben des Probanden und den Identifikationsangaben der entsprechenden Probe
Bearbeitung von Genomdaten, um Strangorientierung, Kompatibilitätsprobleme und die Umbenennung von Kennzeichnern anzugehen

 

BC|RESOURCE

Eine Hardware für die Speicherung riesiger Datenmengen und umfassende Berechnungen ist nicht billig. Die Entwicklung der Cloud-Technologien hat Verfügbarkeit, Nutzbarkeit und Wirtschaftlichkeit von gemieteten Ressourcen stark verbessert. BC|RESOURCE besteht aus optionalen Paketen für Archivierung, Backups und erweiterbare Rechenkapazitäten in Cloud-Diensten bei den bekanntesten Anbietern der Welt. BC|RESOURCE bietet eine einfach zu verwaltende Schnittstelle zum Mieten und Nutzen von Cloud-Ressourcen, abhängig von Ihren Projektbedürfnissen. Die Optionen umfassen Langzeitverträge über Speicherung und Backup sowie nachgefragte Anmietungen von Analysekapazitäten. Unser Cloud-Team ist sehr erfahren in zahlreichen unterschiedlichen Szenarien und bespricht mit Ihnen gerne Ihre spezifischen Bedürfnisse und die günstigsten Optionen.

Backups und Archivierung

Amazon S3-Implementierung für Archive und selten genutzte Daten, gleichzeitig jedoch mit regelmäßigem Zugang
Implementierung von Amazon Glacier für Backups und Wiederherstellung, der ultimative Datengefrierschrank

Analyse- und Rechenressourcen

Amazon S2-Cloud-Server als spezifischer Berechnungsknoten mit direkter Verbindung zur BC-Analyseschlange und dem Ergebnisspeichersystem
Virtuelle oder direkte IBM SoftLayer-Server als spezifische Berechnungsknoten mit direkter Verbindung zur BC-Analyseschlange und zum Ergebnisspeichersystem
Virtuelle oder direkte IBM SoftLayer-Server für die Durchführung von integrierten BC-Betriebssystem-Setups für unterschiedliche Projekte

 

BC|SAMPLE

BC|SAMPLE ist ein Mehrzweck-Tool für Probennachverfolgung und Prozessmanagement. BC|SAMPLE unterstützt platten- und probenorientierte Arbeitsabläufe, Location-Tracking, Plattenerstellung und -verarbeitung und Instrumentenschnittstellen. Berichte über Probensammlung und -verarbeitung können leicht erstellt werden, und Protokolle können zur Flüssigkeitsbehandlung oder zu sonstigen Instrumenten exportiert werden. BC|SAMPLE speichert wiederholte Ergebnisse bei der Probenverarbeitung für eine einfache Ansicht von Probenstatus und -verlauf.

BC|SAMPLE kommuniziert mit BC|DATA, BC|CLIN und BC|GENOME, wodurch die Probendaten samt den Probandeninformationen für Querverweise genutzt werden können. BC|SAMPLE entspricht denselben Datensicherheitseigenschaften und -standards wie BC|DATA und bietet eine Zugangskontrolle auf Gruppen-, Rollen- und Datensatzebene sowie eine vollständige Nachverfolgung von Probeneigentum und -verlauf.

Genomprobensammlungen und Labore

Bietet strukturierte Pläne zur Probenregistrierung mit automatisierten IDs
Synchronisiert Dateneingabe und -bearbeitung mit BC|DATA, wenn erforderlich
Verfolgt wiederholte Probenverarbeitungen nach und bietet Berichtsergebnisse
Pipettierungspläne und Verwässerungsberechnungen
Leichter Label-Editor im Lieferumfang enthalten, der die gängigen Barcode-Formate unterstützt
Berichte zur Probenverarbeitung und zu ausgewählten Parametern

 

 

BC|DATA

Die Hauptstärke des BC-Betriebssystems ist die Fähigkeit, konventionelle Datenbanksuchanfragen mit komplexen, statistischen Analysearbeitsabläufen übergangslos zu verbinden, unabhängig von der Datenmenge oder der Analyseart. Dies ist ein guter Ausgangspunkt für interne Entwicklungen und die Anpassung bestehender Arbeitsabläufe für die Automation und die Parallelisierung. BC|DATA stellt eine Basis dar, auf der Datenbankadministratoren und Bioinformatiker ihre maßgeschneiderten Plattformen, Nutzerschnittstellen und Community-Portale aufbauen können. Deswegen eignet es sich hervorragend für Pionierprojekte, bei denen entwickelte oder veröffentlichte Tools noch nicht bestehen oder optimiert werden müssen.

Pionierdatenerfassung

Flexible Datenmodelle für Entdeckungen
Interne Methodenentwicklung
Fähigkeit zur Integration von maßgeschneiderten Statistik-Tools und -Skripten

Community-Schnittstellen und Portale

Datenschema für die Interaktion mit Genomdatenbanken
API für eine Nutzerschnittstelle, um Daten für Suchanfragen herauszuziehen

BC|CLIN

BC|CLIN ist eine flexible und skalierbare Plattform zur Verwaltung von Patientendatensammlungen jeglicher Art. BC|CLIN bietet eine einfache Umsetzung von Web-basierten Patientenfragebögen für Longitudinalstudien und umfassende und einfache Tools für Suchen, Berichte und Stratifizierung. Für den Datenexport können statistische Programme genutzt werden, um Berichte zu erstellen und das Patienten-Profiling zu leiten. Die Plattform erleichtert die vereinheitlichte Eingabe aus unterschiedlichen Quellen, senkt das Risiko menschlicher Fehler und erhöht die Qualität der Datensammlung. BC|CLIN entspricht strengsten Datensicherheitsstandards und kontrolliert die Nutzergenehmigungen auf Gruppen-, Rollen- und Datensatzebene.

BC|CLIN und BC|GENOME können problemlos gemeinsam genutzt werden, wobei gesammelte klinische Daten direkt für die Analyse durch das leistungsstarke Tool-Paket in BC|GENOME dargestellt und Genomanalyseergebnisse in die Patientendaten eingebettet werden. BC|CLIN vereinfacht Quersuchen in BC|SAMPLE für Probenverarbeitungsinformationen und die Stratifizierung von Patientensammlungen auf Grundlage von Probeninformationen in BC|SAMPLE.

Epidemiologische Studien und klinische Erfassungen

  • Komplexe Suche in Patientendaten und deren Krankengeschichte
  • Klinische Longitudinaldatensammlung
  • Gen- und probenbasierte Stratifizierung von Patienten
  • Weltweite Zusammenarbeit dank gewährleisteter Datensicherheit
  • Komplexe Patientenfragebögen einfach gestaltet – gedruckt oder als Web-Formulare

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